Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr5P51682 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms