Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RorcP51450 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RorcP51450 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RorcP51450 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms