Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SftpdP50404 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SftpdP50404 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms