Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc13P50207 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms