Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CitP49025 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CitP49025 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CitP49025 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CitP49025 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CitP49025 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms