Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb41P48193 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms