Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr7P47774 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms