Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms