Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmx2P43687 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmx2P43687 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms