Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms