Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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