Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms