Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms