Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms