Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lig1P37913 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms