Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprkP35822 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms