Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpoP35419 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpoP35419 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms