Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms