Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms