Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms