Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms