Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VtnP29788 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VtnP29788 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VtnP29788 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VtnP29788 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VtnP29788 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VtnP29788 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VtnP29788 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms