Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms