Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms