Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms