Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defa5P28312 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms