Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms