Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpbP27790 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CenpbP27790 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms