Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpbP27048 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpbP27048 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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