Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd7P26516 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd7P26516 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms