Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms