Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms