Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Hoxd11P23813 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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