Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hoxd12P23812 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hoxd12P23812 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hoxd12P23812 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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