Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms