Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms