Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmnb2P21619 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms