Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms