Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms