Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TP20293 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TP20293 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TP20293 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TP20293 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TP20293 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TP20293 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms