Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VimP20152 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VimP20152 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VimP20152 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VimP20152 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VimP20152 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VimP20152 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VimP20152 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VimP20152 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms