Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NefhP19246 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NefhP19246 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NefhP19246 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NefhP19246 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NefhP19246 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NefhP19246 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NefhP19246 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NefhP19246 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NefhP19246 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NefhP19246 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NefhP19246 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NefhP19246 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NefhP19246 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms