Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F2P19221 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F2P19221 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F2P19221 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F2P19221 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F2P19221 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F2P19221 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F2P19221 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
F2P19221 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F2P19221 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F2P19221 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F2P19221 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F2P19221 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F2P19221 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F2P19221 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F2P19221 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F2P19221 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F2P19221 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F2P19221 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms