Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms