Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18525 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18525 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18525 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18525 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18525 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18525 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18525 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms