Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnaP17918 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnaP17918 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnaP17918 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms