Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs2P17534 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs2P17534 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms