Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms