Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgbP16014 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms