Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme1P15532 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme1P15532 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme1P15532 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms